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¿Como subir a shinyapps.io una aplicación R-Shiny que utiliza el paquete R LidR?

Stack Overflow en español Asked by ElLoko36 on November 27, 2021

El problema es que rsconnect::appDependencies() detecta el paquete R lidR cómo perteneciente a Bioconductor cuando en realidad pertenece a CRAN.

Package:lidR ,Version: 3.0.2 , Source: Bioconductor

El error es el siguiente:

Error: Unhandled Exception: Child Task 765333282 failed: Error parsing manifest: Unable to determine package source for Bioconductor package lidR: Repository must be specified

Ya no sé que más probar. La solución que suelen dar como válida no funciona:

options(repos = BiocManager::repositories())

Mi repositorio contiene lo siguiente:

getOptions ("repos")

BioCsoft: "https://bioconductor.org/packages/3.11/bioc",
BioCann: "https://bioconductor.org/packages/3.11/data/annotation",
BioCexp: "https://bioconductor.org/packages/3.11/data/experiment", BioCworkflows: "https://bioconductor.org/packages/3.11/workflows",
CRAN: "https://cran.rstudio.com/"

Gracias.

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